Proposta de pipeline de genômica para melhoramento de soja
Visão geral
Sobre o que é este desafio
Você desenha um pipeline de genômica para soja, do dado bruto ao VCF, e entrega um módulo funcional. Recebe um certificado verificável.
O Brief
O que você vai fazer e o que vai demonstrar.
Como projetar um pipeline reproduzível e escalável de genômica computacional que leve de forma automática do dado bruto de sequenciamento até uma lista confiável de variantes genéticas por linhagem?
Earning criteria — what you'll demonstrate
- Projetar um fluxo de trabalho completo de genômica computacional, do sequenciamento bruto à chamada de variantes
- Aplicar princípios de bioinformática à padronização e reprodutibilidade de análises de sequências genéticas
- Analisar o custo computacional das etapas do pipeline e escolher pontos de paralelização adequados
- Especificar orquestração e automação de infraestrutura para processar dados genômicos em escala
- Documentar decisões técnicas de forma que uma equipe de pesquisa consiga reproduzir os resultados
Adequação ao Programa
Onde isso se encaixa no seu programa.
Aperfeiçoa as mesmas habilidades que seu curso espera que você demonstre.
Conteúdo alinhado em breve.
Habilidades
Habilidades que você vai demonstrar.
Cada um aparece no seu certificado verificado.
Carreiras
Cargos para os quais este desafio te prepara.
Títulos reais. Pontes reais de habilidades. Escolha o mais próximo da sua trajetória.
Trilhas de carreira que este desafio desenvolve
Funções canônicasData Engineer
Você projeta um pipeline reproduzível que move e transforma grandes volumes de dados de forma orquestrada e escalável — o dia a dia de um Data Engineer, que constrói fluxos automáticos, versiona etapas e garante que o mesmo dado sempre gere o mesmo resultado.
Este desafio aprimora
- airflow-dags
- apache-spark
- architecture-decision-records-adrs
Data Architect
A proposta exige estruturar todo o caminho do dado genômico bruto até variantes consultáveis, com decisões de armazenamento e escala. Isso corresponde ao trabalho de um Data Architect, que define a estrutura e o fluxo de dados de ponta a ponta em um domínio de alto volume.
Este desafio aprimora
- algorithm-analysis
- advanced-iac-modules
- architecture-decision-records-adrs
MLOps Engineer
Orquestração, reprodutibilidade, versionamento e automação de infraestrutura são o núcleo do trabalho de um MLOps Engineer. Ao empacotar etapas em ambientes reproduzíveis e escaláveis, você exercita exatamente as práticas que sustentam pipelines de produção.
Este desafio aprimora
- airflow-dags
- advanced-iac-modules
- ansible-terraform-automation
Só mais uma coisa