Análisis de Single-Cell RNA-seq para un Laboratorio de Investigación en Chile
Visión general
De qué trata este proyecto.
Implementa un pipeline de single-cell RNA-seq con Scanpy y scVI, integra muestras y genera un reporte HTML. Obtén un certificado verificable.
El escenario
El laboratorio (5 PI, 12 estudiantes doctorales) compite por papers con grupos de Boston y Cambridge; reproducibilidad es el cuello de botella señalado por la revisora de su último submission a Nature Communications.
El Briefing
Lo que harás y lo que demostrarás.
Construir un pipeline scRNA-seq reproducible con integración entre muestras y anotación celular, entregando reporte HTML compartible y comparativa contra baseline sin corrección.
Earning criteria — what you'll demonstrate
- Aplicar QC scRNA-seq con criterios defendibles (gene count, MT%, doublet detection)
- Integrar muestras con scVI y evaluar corrección de batch effect
- Anotar tipos celulares con CellTypist + marcadores manuales
- Producir investigación reproducible end-to-end (entorno, semillas, datos)
Encaje académico
Dónde encaja esto en tus estudios.
Afina las mismas habilidades que tu titulación espera de ti.
Computational Biology and Health Informatics
Master · General Studies
Strong alignment
This challenge maps to Computational Biology and Health Informatics at the Master level. It sharpens the same practical skills your coursework expects — but in a real industry context with actual constraints and deliverables.
Habilidades
Habilidades que demostrarás.
Cada una aparece en tu credencial verificada.
- Single Cell Genomics
Apply single cell genomics to solve real industry problems and demonstrate production-level capability.
- Scanpy
Apply scanpy to solve real industry problems and demonstrate production-level capability.
- Scvi
Apply scvi to solve real industry problems and demonstrate production-level capability.
- Data Integration
Apply data integration to solve real industry problems and demonstrate production-level capability.
- Reproducible Research
Apply reproducible research to solve real industry problems and demonstrate production-level capability.
- Python
Write clean, efficient Python for data processing, automation, and backend services.
Carreras
Roles para los que esto te prepara.
Títulos reales. Puentes de habilidades reales. Elige el que más se acerque a tu trayectoria.
Ingeniero de Datos
Construir pipelines reproducibles de datos high-dimensional con integración y reporte es trabajo de ingeniero de datos en biomedicina — perfil con demanda creciente en farma y academia.
Este proyecto afina
- data-integration
- reproducible-research
- python
Ingeniero de Software
Empaquetar análisis científicos como pipelines reproducibles es el músculo que separa al investigador del ingeniero — habilidad transferible a cualquier ingeniería de software con cargas científicas.
Este proyecto afina
- reproducible-research
- single-cell-genomics
- python