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Pipeline de Llamada de Variantes para una CRO Farma de Madrid

FreeVerified credential4 semanasAdvanced

Visión general

De qué trata este proyecto.

Diseña un pipeline Nextflow para llamada de variantes en una CRO farmacéutica y obtén un certificado verificable.

El escenario

La CRO (alrededor de 65 personas, certificación ISO 17025 en curso) atiende a una farma europea y dos LATAM; un pipeline auditable es prerrequisito para el siguiente contrato — la última auditoría señaló trazabilidad como riesgo principal.

CredentialBlockchain-anchored
ShareableLinkedIn-ready
LanguageEnglish
PaceSelf-paced

El Briefing

Lo que harás y lo que demostrarás.

Implementar un pipeline Nextflow de llamada de variantes alineado a GATK4 best practices con sensibilidad y precisión > 99% sobre NA12878 y trazabilidad por muestra.

Earning criteria — what you'll demonstrate

  • Diseñar workflows de bioinformática reproducibles con Nextflow
  • Aplicar GATK4 best practices para llamada de variantes germinales
  • Validar pipelines contra truth sets oficiales (NA12878 GIAB)
  • Producir trazabilidad por muestra apta para auditoría externa

Encaje académico

Dónde encaja esto en tus estudios.

Afina las mismas habilidades que tu titulación espera de ti.

Alineación con asignaturas próximamente.

Carreras

Roles para los que esto te prepara.

Títulos reales. Puentes de habilidades reales. Elige el que más se acerque a tu trayectoria.

Ingeniero de Datos

Construir un pipeline reproducible y auditable con orquestación, contenedores y validación es exactamente el músculo de un ingeniero de datos en sectores regulados — la transición a bioinformática es directa.

Este proyecto afina

  • nextflow
  • workflow-orchestration
  • data-validation

Ingeniero de Software

Diseñar pipelines modulares contenedorizados con validación frente a truth sets es el patrón estándar de testing de sistemas científicos — habilidad transferible a cualquier ingeniería de software con cargas computacionales.

Este proyecto afina

  • bioinformatics
  • containerization
  • data-validation

Una cosa más

Puedes tener una credencial en tu CV para el viernes.