Predicción de Estructura de Proteínas con AlphaFold para una Biotech Argentina
Visión general
De qué trata este proyecto.
Configura un workflow con ColabFold (o OpenFold local en GPU) para predecir estructura de 12 proteínas diana, incluyendo MSA (Multiple Sequence Alignment) generation y 5 modelos por diana. Compara predicciones con estructuras experimentales (PDB) cuando estén disponibles (8 de 12), midiendo RMSD y pLDDT. Para las 4 sin referencia experimental, evalúa confiabilidad por pLDDT y PAE. Estima coste GPU por predicción y compara escenarios (ColabFold gratuito vs OpenFold en cloud propio). Entrega resultados, análisis de coste y recomendación de workflow.
El Briefing
Lo que harás y lo que demostrarás.
Evaluar AlphaFold-based predictions para 12 dianas terapéuticas y recomendar un workflow operativo que balancee coste GPU vs valor científico.
Earning criteria — what you'll demonstrate
- Ejecutar predicciones AlphaFold/ColabFold/OpenFold end-to-end
- Interpretar métricas de confianza estructural (pLDDT, PAE)
- Comparar predicciones con estructuras experimentales con criterio
- Razonar sobre coste-beneficio de cómputo GPU en investigación
Encaje académico
Dónde encaja esto en tus estudios.
Afina las mismas habilidades que tu titulación espera de ti.
Habilidades
Habilidades que demostrarás.
Cada una aparece en tu credencial verificada.
Carreras
Roles para los que esto te prepara.
Títulos reales. Puentes de habilidades reales. Elige el que más se acerque a tu trayectoria.
Trayectorias profesionales que esto construye
Roles canónicosIngeniero de Software
Evaluar herramientas científicas pesadas en GPU con métricas honestas y análisis de coste es trabajo de ingeniero de software en biotech — perfil escaso en LATAM.
Este proyecto afina
- alphafold
- scientific-evaluation
- python
Ingeniero de Datos
Orquestar predicciones estructurales en GPU, gestionar MSAs y agregar métricas son los patrones que un ingeniero de datos en farma aplica a diario.
Este proyecto afina
- gpu-computing
- structural-bioinformatics
- python