Predicción de Propiedades Moleculares con GNN para Startup Farmacéutica en Bilbao
Visión general
De qué trata este proyecto.
Recibirás un dataset público (MoleculeNet) más ~4.500 moléculas internas anonimizadas etiquetadas con 4 propiedades ADMET. Implementa una MPNN (Message Passing Neural Network) sobre la representación grafo de cada molécula (átomos = nodos, enlaces = aristas). Compara contra baselines (random forest sobre Morgan fingerprints). Mide ROC-AUC por propiedad, calibración (Brier score) y robustez frente a moléculas fuera de distribución. Diseña una API simple que el equipo de química pueda invocar para puntuar candidatos. Entrega modelos, API y memo de 3 páginas.
El Briefing
Lo que harás y lo que demostrarás.
Entrena una MPNN para predecir propiedades ADMET de moléculas y expón los modelos en una API utilizable por el equipo de química.
Earning criteria — what you'll demonstrate
- Representar moléculas como grafos y aplicar MPNN
- Comparar GNN contra baselines de fingerprints clásicos
- Medir calibración del modelo (Brier score), no solo discriminación
- Exponer modelos en una API consumible por equipos no ML
Encaje académico
Dónde encaja esto en tus estudios.
Afina las mismas habilidades que tu titulación espera de ti.
Habilidades
Habilidades que demostrarás.
Cada una aparece en tu credencial verificada.
Carreras
Roles para los que esto te prepara.
Títulos reales. Puentes de habilidades reales. Elige el que más se acerque a tu trayectoria.
Trayectorias profesionales que esto construye
Roles canónicosInvestigador en Aprendizaje Automático
Modelar moléculas con GNN y comparar contra fingerprints es trabajo del ML Researcher en biotech aplicado.
Este proyecto afina
- graph-neural-networks
- message-passing
- molecular-ml
Científico en IA Aplicada
Calibración, robustez OOD e integración con química son trabajo del Applied AI Scientist en biotech.
Este proyecto afina
- model-calibration
- molecular-ml
- message-passing
Ingeniero en IA
Exponer el modelo como API para un equipo no ML es trabajo del AI Engineer.
Este proyecto afina
- fastapi
- pytorch-geometric
- molecular-ml