Variant-Calling-Pipeline für ein Penzberger Pharmaunternehmen
Übersicht
Worum es bei diesem Projekt geht.
Baue eine Variant-Calling-Pipeline mit Snakemake für ein Pharmaunternehmen und erhalte ein verifizierbares Zertifikat.
Das Briefing
Was Du tust und was Du zeigst.
Wie lässt sich eine moderne, reproduzierbare Variant-Calling-Pipeline so aufbauen, dass sie zwischen Standorten identische Ergebnisse liefert und in unter 90 Minuten auf öffentlichen Beispieldaten läuft?
Earning criteria — what you'll demonstrate
- Eine vollständige Variant-Calling-Pipeline auf einer realen Datenquelle entwerfen
- Reproduzierbarkeit über conda und Container praktisch umsetzen
- Truth-Set-Vergleiche und Confusion-Matrix-Metriken (Precision, Recall) interpretieren
- Workflow-Management-Werkzeuge für mehrstufige Bioinformatik-Pipelines wählen
Studienpassung
Wo dies in Dein Studium passt.
Schärft dieselben Fähigkeiten, die Dein Studium von Dir erwartet.
Computational Biology and Health Informatics
Master · Cs Se
Fit score: 1
Fähigkeiten
Fähigkeiten, die Du unter Beweis stellst.
Jede taucht auf Deinem verifizierten Zertifikat auf.
Karrieren
Berufe, auf die dies Dich vorbereitet.
Echte Berufsbezeichnungen. Echte Skill-Brücken. Wähle die, die Deinem Werdegang am nächsten kommt.
Karrierewege, die das aufbaut
Kanonische RollenSoftware Engineer
Bioinformatik-Pipelines sind ein wachsendes Anwendungsfeld für Software Engineers in Pharma und Forschung. Reproduzierbarkeit und Workflow-Management lassen sich auf jede mehrstufige Datenpipeline übertragen.
Dieses Projekt schärft
- bioinformatics
- workflow-management
- reproducibility
Noch eine Sache