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Variant-Calling-Pipeline für ein Penzberger Pharmaunternehmen

FreeVerified credential4 WochenAdvanced

Übersicht

Worum es bei diesem Projekt geht.

Baue eine Variant-Calling-Pipeline mit Snakemake für ein Pharmaunternehmen und erhalte ein verifizierbares Zertifikat.

Das Szenario

Das Pharmaunternehmen plant, die interne Variant-Pipeline für drei klinische Forschungsprogramme zu konsolidieren; Reproduzierbarkeit ist Voraussetzung für die nächste GxP-Audit-Runde.

CredentialBlockchain-anchored
ShareableLinkedIn-ready
LanguageEnglish
PaceSelf-paced

Das Briefing

Was Du tust und was Du zeigst.

Wie lässt sich eine moderne, reproduzierbare Variant-Calling-Pipeline so aufbauen, dass sie zwischen Standorten identische Ergebnisse liefert und in unter 90 Minuten auf öffentlichen Beispieldaten läuft?

Earning criteria — what you'll demonstrate

  • Eine vollständige Variant-Calling-Pipeline auf einer realen Datenquelle entwerfen
  • Reproduzierbarkeit über conda und Container praktisch umsetzen
  • Truth-Set-Vergleiche und Confusion-Matrix-Metriken (Precision, Recall) interpretieren
  • Workflow-Management-Werkzeuge für mehrstufige Bioinformatik-Pipelines wählen

Studienpassung

Wo dies in Dein Studium passt.

Schärft dieselben Fähigkeiten, die Dein Studium von Dir erwartet.

Studienzuordnung folgt in Kürze.

Karrieren

Berufe, auf die dies Dich vorbereitet.

Echte Berufsbezeichnungen. Echte Skill-Brücken. Wähle die, die Deinem Werdegang am nächsten kommt.

Software Engineer

Bioinformatik-Pipelines sind ein wachsendes Anwendungsfeld für Software Engineers in Pharma und Forschung. Reproduzierbarkeit und Workflow-Management lassen sich auf jede mehrstufige Datenpipeline übertragen.

Dieses Projekt schärft

  • bioinformatics
  • workflow-management
  • reproducibility

Noch eine Sache

Du kannst ein Zertifikat bis Freitag in Deinem Lebenslauf haben.